Alloimmun, eller isoimmun, neutropeni hos nyfödda förekommer i fostret på grund av den antigena inkompatibiliteten hos neutrofilerna hos fostret och moderen. Isoantikroppen av moderen tillhör IgG-klassen, de tränger in i placenta-barriären och förstör barnets neutrofiler. Isoantikroppar är vanligtvis leukoagglutininer, de reagerar med cellerna hos patienten och hans far, reagerar inte med moderns celler.