Det orsakssamband som orsakas av tippburen virusencefalit hör till släktet Flaviviruses. Virionen har en sfärisk form, en diameter av 40-50 nm, innehåller RNA, reproducerar väl i många vävnadsodlingar. Av laboratoriedjur är vita möss, hamstrar, apor och bomullsrottor mest mottagliga för viruset. Känslig för fästbåren encefalitvirus och många husdjur.