HCV-genomet innehåller den positivt laddade enkelsträngat RNA, som kodar för tre strukturella (nukleokapsid kärnprotein och nukleoproteiner E1-E2 kuvert) och 5 strukturella (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteiner. Till var och en av dessa proteiner syntetiseras AT, som finns i blodet hos patienter med viral hepatit C.