Forskare har identifierat ett potentiellt mål för ett framtida HIV-vaccin

Det mänskliga immunbristviruset har kunnat undvika skaparna av vacciner i 30 år, i synnerhet på grund av dess otroliga förmåga att mutera, vilket gör det enkelt att kringgå alla förinställda hinder.

Men här, det verkar, forskare vid Massachusetts Institute of Technology och Institutet för Reygona (båda - USA) lyckats hitta en lovande strategi för framtida vaccin design som använder en matematisk metod som med framgång har testats för att lösa problemen med kvantfysik, samt analys av svängningar i priserna på värdepappersmarknaden .

Vacciner lär immunsystemet att reagera omedelbart på patogenernas specifika molekylära egenskaper. Men immunbristvirusens (HIV) förmåga till mutationer gör det nästan omöjligt att välja rätt vaccin. På jakt efter en ny strategi beslutade forskare att överge målningen av enskilda aminosyror. Istället bestämde de sig för att identifiera oberoende utvecklande grupper av aminosyror i proteiner, när inom varje grupp aminosyrorna utvecklas i tandem, det vill säga "titta på varandra" för att upprätthålla virusets livskraft. Särskilt ihållande sökte forskarna efter sådana grupper, där utvecklingen inom vilken skulle ha maximal chans att hamna för hiv-kollaps - dess ytterligare ogenomtränglighet. Då, när man utför en multilateral attack, skulle det vara exakt dessa platser av viruset som skulle kunna fångas mellan de två bränderna: antingen skulle det vara upprörd av immunsystemet, eller det skulle mutera och självdestruktiva.

Med hjälp av teorin om slumpmässiga matriser sökte forskargruppen efter evolutionära begränsningar i det så kallade Gag-protein-hiv-segmentet, vilket bildar virusets proteinkuvert. Det var nödvändigt att hitta kollektivt utvecklande grupper av aminosyror med en hög grad av negativa korrelationer (och ett lågt antal positiva som tillåter viruset att överleva), när många mutationer förstör viruset. Och sådana kombinationer hittades i regionen, som forskarna själva kallade Gag-sektor 3. Han är inblandad i att stabilisera virusets proteinkuvert, så flera mutationer på denna sida är fyllda med virusets struktur genom kollaps.

Intressant, när forskarna studerade fall av HIV-infekterade människor som av naturen kan avvärja virusattacker, fann de att immunsystemet hos sådana patienter utförde attacker främst på Gag-segmentet 3.

Författarna försöker nu att hitta andra liknande regioner i strukturen av viruset utanför Gag-sektorn, samt utvecklingselement av de aktiva komponenterna i den framtida vaccin som lär immunsystemet att reagera omedelbart på närvaron av proteiner Gag sektorn 3 och omedelbart attackera honom på lämpligt sätt.

Djurprov är på väg och för närvarande kommer alla detaljer av arbetet att presenteras vid 56: e årliga biofysiska samhällskonferensen, som hålls den 25-29 februari i San Diego, Kalifornien, USA. En sammanfattning av presentationen finns på denna länk.

[1], [2], [3], [4], [5], [6], [7], [8], [9], [10]