Värd-RNA-inkludering kopplat till kronisk hepatit E-infektion

Om viruset införlivar segment av värdens genom i sin genetiska sammansättning kan infektionen bli kronisk.

• Varför blir hepatit E kronisk hos vissa patienter, och varför fungerar inte mediciner?

För att ta reda på det observerade ett internationellt team av forskare ledda av forskare från Bochum en patient med kronisk hepatit E-infektion under ett år. Omsekvensering av det virala RNA:t visade att viruset hade införlivat olika delar av värd-mRNA:t i sitt genom. Detta resulterade i en replikeringsfördel som kunde bidra till infektionens kroniska karaktär.

• Start av värd-RNA kan förutsäga övergång från akut till kronisk infektion

Dr. Daniel Todt, chef för Computational Virology Research Group, Institutionen för medicinsk och molekylär virologi, Ruhr University Bochum, Tyskland

Forskare rapporterade detta i tidskriften Nature Communications.

• Sekvensering av viruspopulationen

Omkring 20 miljoner människor världen över infekteras med hepatit E varje år. Infektionen går oftast över utan konsekvenser, men den kan vara livshotande för gravida kvinnor eller personer med nedsatt immunförsvar. I vissa fall blir det kroniskt. Det finns inga specifika effektiva läkemedel. Det bredspektrum antivirala läkemedlet ribavirin används också mot hepatit E, men det fungerar inte alltid.

• Hur flyr viruset från immunsystemet? Varför blir infektionen kronisk och går inte över?

Forskare har för första gången analyserat hela viruspopulationen hos en kroniskt infekterad patient i mer än ett år. De studerade mer än 180 individuella sekvenser från blodprover i detalj.

• Replikation i cellkultur med värd-RNA

"Hepatit E-viruset har en så kallad hypervariabel region i sin genetiska information, i vilken det kan inkorporera olika RNA-sekvenser från värdcellerna", förklarar Daniel Todt. Hans team kunde visa att sammansättningen av denna region förändrades avsevärt under observationsperioden. Dessutom uppstod många olika kompositioner samtidigt. I cellodlingsexperiment visades det att inkorporeringen av värd-RNA gav en replikationsfördel: de modifierade virusen kunde replikera bättre än andra. "Vi misstänker att detta delvis är ansvarigt för infektionens kroniska karaktär och misslyckande med behandlingen", säger Daniel Todt.

• Studie av värd-RNA inkorporerat i viruset

Forskarna analyserade sammansättningen av värd-RNA:t som inkorporerats i viruset för att avgöra om det fanns gemensamma drag som karakteriserade de genetiska segmenten. – Vi kunde dock inte hitta några betydande likheter, säger Todt. De inkluderade gensekvenserna är oftast de som är mycket vanliga i värdcellerna, vilket indikerar slumpmässigt urval.

• "Det är möjligt att det under hepatit E-infektion finns en kapplöpning mellan viruset och immunsystemet i kroppen", föreslår Daniel Todt.

Om viruset lyckas inkludera värd-RNA innan immunsystemet framgångsrikt bekämpar infektionen, kan detta leda till kroniska sjukdomar. "Värd-RNA i det virala genomet kan i alla fall fungera som en biomarkör i den akuta fasen av infektion, vilket indikerar den tidiga sannolikheten för kronisk sjukdom."

• Planerar ytterligare studier

Forskarna planerar att utöka sina studier till större grupper av patienter.