Ny metod ska göra det möjligt att utveckla läkemedel snabbare

En internationell grupp forskare från Frankrike, Amerika och Ryssland har utvecklat en ny unik metod för att skapa läkemedel som skiljer sig från de som finns idag i sin hastighet. Tack vare den nya metoden för att modellera interaktioner mellan proteiner kommer det att vara möjligt att påskynda processen för att utveckla vacciner och läkemedel, och biokemister kommer också att få ny potential för att bedriva forskning.

Nu står forskare inför uppgiften att utveckla läkemedel som inte orsakar biverkningar, absorberas helt av kroppen och endast förstör ohälsosamma celler. För en cell är protein det huvudsakliga byggmaterialet, i en cell sker många interaktioner (hundratusentals), och studiet av dessa processer kommer att göra det möjligt för forskare att utveckla nya metoder för att behandla farliga sjukdomar och skapa nya biologiska material för att uppfinna läkemedel.

Specialister från olika länder, under ledning av professor Dmitry Kozakov från Stony Brook University, kunde skapa och studera en datormodell som kan beräkna strukturer som bildas under interaktionen mellan två proteiner flera gånger snabbare (den nya modellen är tiotals gånger snabbare än liknande system som finns idag).

Enligt forskare är laboratoriestudier ganska dyra, eftersom de kräver reagens och dyr utrustning. För små forskargrupper är datormodellering det bästa alternativet. Det finns för närvarande många datorsystem som beräknar interaktionen mellan proteiner, men tyvärr kan inte alla befintliga system beräkna ett stort antal proteininteraktioner på kort tid. Alla algoritmer som för närvarande används för att övervaka konfigurationer separat, utan att kombinera dem, och den nya metoden från professor Kozakovs team gör det möjligt att analysera alla komplex samtidigt på kort tid, och detta gör det möjligt att accelerera processen upp till 100 gånger utan att påverka kvaliteten på slutresultatet.

Med hjälp av en datormodell som grund kommer specialister att kunna utveckla läkemedel inte bara snabbare, utan också avsevärt minska deras kostnader. Den nya metoden för datormodellering gör det inte bara möjligt att beräkna proteininteraktioner, utan också att analysera strukturen hos levande organismer (både djur och människor). Enligt specialister kommer den nya metoden att möjliggöra utveckling av effektiva läkemedel mot HIV och onkologiska sjukdomar, och på kort tid kommer det att vara möjligt att framställa ett tillräckligt antal läkemedel.

Forskarna publicerade en artikel med resultaten av sitt arbete i en av de vetenskapliga tidskrifterna, där specialisterna i detalj beskrev en ny metod för datormodellering av proteininteraktioner.

Detta arbete är inte avsett för kommersiellt bruk, utan är en grundläggande studie, så vi kan tala om arbetet som utförts från det ögonblick det publiceras i en vetenskaplig publikation. Nu används den nya algoritmen redan på den publika ClusPro-servern som ett nytt datorsystem och är tillgängligt för alla.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ]